איך לדנטור חלבון?
כאשר החלבון המדובר קיים במזון, פשוט בישול המזון יכחיש את החלבונים.
אולי אתה רוצה לדנטר חלבון לפרויקט מדעי, או אולי קראת על אוכל מפוגל ורוצה לדעת איך זה עובד. דנטורציה היא התהליך שבו חלבון מאבד את צורתו ומבנהו עקב פעולות של כוחות חיצוניים, כולל חום, קרינה, חומצות וממיסים. ממיסים אורגניים בדרך כלל מכנים חלבונים. הדרך המדויקת בה אתה מנטרל חלבון תלויה בחומר המסוים שאיתו אתה רוצה לעבוד, מכיוון שכולם דורשים סוכני דנטורציה שונים ברמות שונות. אם כי אתה יודע מה לשנות בסביבת החלבון, ניתן לדנטור את כל החלבונים.
שיטה 1 מתוך 2: דנטורציה של חלבון
- 1השתמש בחום. חום הוא אחת הדרכים הקלות ביותר והדרכים הנפוצות ביותר לנטרול חלבון. כאשר החלבון המדובר קיים במזון, פשוט בישול המזון יכחיש את החלבונים. ניתן לדנטור חלבונים רבים על ידי חשיפתם לטמפרטורה של מעל 100 מעלות צלזיוס (100 מעלות צלזיוס). זה מאפשר לחלבונים להתקרש ולהפחית את המסיסות שלהם.
- משך החשיפה תלוי במה שאתה חושף לחום. ביצה, למשל, עשויה לבשל במחבת על אש בינונית תוך חמש דקות, ואילו צלייה עשויה לקחת שעות לבשל בתנור.
- 2החל אלכוהול. אלכוהול משבש את קשרי המימן המתרחשים בין קבוצות אמיד של קשר פפטיד. כאשר חלבון נחשף לתמיסת אלכוהול, מולקולות האלכוהול יוצרות קשרים חדשים עם שרשרת החלבון. השתמש בתמיסה של 70% אלכוהול כדי לפרוץ את דופן התא של החיידקים ולנטרל את החלבון.
- אלכוהול מרוכז יכול להיות מסוכן, מכיוון שהם דליקים ורעילים כאחד. ללבוש תמיד ציוד בטיחות מלא כולל כפפות והגנת עיניים, ולטפל בסביבה מאובטחת ומבוקרת טמפרטורה.
- 3שנה את ה- ph. המבנה הפנימי של חלבון ניתן לפירוק כאשר הסביבה שלה היא מאוד חומצי או מאוד אלקליין, כפי שהם לשבש את היוני האג"ח שמחזיק את הגשרים המלחים של החלבון ביחד. הוסף חומצה או תמיסת בסיס לחלבון. הסביבה הסובבת צריכה להיות ב pH של מעל 10 או מתחת 4 כדי לעודד דנטורציה. אם אתה גורם לשינוי עם חומצה, ה- pH צריך להיות בין 2 ל -5.
- שינוי ה- pH יכול ליינן חומצת אמינו, תלוי ב- pKa של כל קבוצה פונקציונאלית באותה חומצת אמינו. ניתן גם ליינן את קבוצת האמינו או את קבוצת הקרבוקסיל הקיימת בחומצת האמינו.
- 4נסה מלחי מתכת כבדה. מתכות כבדות עלולות לשבש קשרים בחלבון ולגרום לו לאבד את מבנהו. מלחים של מתכות כבדות כגון כספית ועופרת עשויים לשמש לניקור חלבונים שונים. מלחים כאלה זמינים אצל רוב הספקים הכימיים, ויש להשתמש בהם תמיד בזהירות ובציוד בטיחות נאות, כולל כפפות והגנה על העיניים.
- מתכות כבדות יכולות לקיים אינטראקציה עם קבוצות השרשרת הצדדיות הפונקציונליות של חלבון כדי ליצור קומפלקסים. מתכות כבדות מחמצנות גם את שרשראות הצד של חומצות האמינו של החלבון.
חום הוא אחת הדרכים הקלות ביותר והדרכים הנפוצות ביותר לנטרול חלבון.
שיטה 2 מתוך 2: מחדש חלבונים
- 1קבע אם חלבון יכול להתקפל מחדש. צורות מסוימות של דנטורציה הן קבועות, ואילו אחרות ניתן לבטל. לא ניתן לבטל בישול של ביצה או בשר, למשל, אך חלבון שנחשף ל- pH גבוה עשוי להחזיר את צורתו כשהוא ממוקם בסביבה ניטרלית יותר.
- אם החלבון יכול להתקפל מחדש או לא יהיה תלוי ב- DNA שלו. ה- DNA ישמור את המידע הדרוש לחלבון כדי לחזור למצבו המקורי.
- 2הסר את הגורם הדנטורינג. החזירו את הסביבה סביב החלבון לקיפאון והסירו את האלמנט הדנטורינג. הסר למשל את החומצה או את הבסיס, או החזיר את החלבון לטמפרטורה סבירה יותר.
- 3השתמש בערכת שינוי. חברות ציוד מעבדה רבות מוכרות ערכות שיפוץ המאפשרות לך לבדוק את הפרמטרים הטובים ביותר כדי לעודד מחדש. ערכות כאלה יכולות להיות מועילות במיוחד אם אתה מסתכל על חלבונים במעבדה או בסביבה ניסיונית.
השתמש בתמיסה של 70% אלכוהול כדי לפרוץ את דופן התא של החיידקים ולדנטור את החלבון.
- חלבון מפוגל מאבד את המבנה הרבעוני, השלישוני והמשני שלו, אשר ניכר במצבו המקורי, אך המבנה העיקרי שלו יישאר.
- חלבון מפוגל מאבד גם חלק מהביו-אקטיביות שלו, בחלק מהמקרים, כמו באנזימים, מאבד את יכולתו לתפקד. לדוגמא, מצעים עשויים שלא להיות מסוגלים עוד להיקשר לאנזימים שעברו דנטורציה.
- החלבון המפוגל עשוי לאבד את מסיסותו בתמיסה.
- ניתן גם לנטרל חומצות גרעין בטכניקות מעבדה להפרדת הגדילים.
קרא גם: כיצד להגדיל את חלבון ה- CREB?
תגובות (1)
- מידע מדויק, תודה.
קרא גם:
כתב ויתור רפואי תוכן מאמר זה אינו מיועד להוות תחליף לייעוץ רפואי מקצועי, בדיקה, אבחון או טיפול. עליך לפנות תמיד לרופא שלך או לאיש מקצוע רפואי מוסמך אחר לפני תחילת, שינוי או הפסקת טיפול רפואי כלשהו.
